Історики та архітектори-дослідники працювали паралельно, поєднуючи фахове наукове дослідження та сучасні технології 3D моделювання, зокрема інструменти архітектурної криміналістики.
Для створення цифрової
3D-моделі Бабиного Яру використовували комбінацію різних матеріалів – топографічних зйомок 1924, 1953, 1968 та 2008 років, аерофотозйомки 1939 та 1943 років, супутникових знімків та фотографій місцевості, зроблених у різні періоди на території Бабиного Яру, починаючи з 1930 року. На основі цих досліджень ландшафт Бабиного Яру 1940-х років був реконструйований у 3D. Реконструкцією займалися спеціалісти Центру Просторових Технологій.
Архітектори співставили просторові елементи з карт та аерофотозйомки з реальними об'єктами – деревами, електричними стовпами, будинками, схилами яру, які були зафіксовані на фото. Бралося до уваги і положення сонця на небосхилі.